Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CHRNA3P32297 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA3P32297 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms