Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TM4SF1P30408 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TM4SF1P30408 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TM4SF1P30408 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TM4SF1P30408 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms