Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND3P30281 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND3P30281 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND3P30281 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND3P30281 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND3P30281 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND3P30281 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND3P30281 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND3P30281 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND3P30281 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND3P30281 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND3P30281 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND3P30281 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND3P30281 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND3P30281 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND3P30281 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND3P30281 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND3P30281 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND3P30281 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND3P30281 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND3P30281 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND3P30281 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND3P30281 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND3P30281 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND3P30281 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCND3P30281 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCND3P30281 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCND3P30281 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCND3P30281 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCND3P30281 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCND3P30281 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCND3P30281 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCND3P30281 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCND3P30281 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCND3P30281 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCND3P30281 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCND3P30281 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCND3P30281 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCND3P30281 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND3P30281 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND3P30281 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND3P30281 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND3P30281 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND3P30281 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND3P30281 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND3P30281 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND3P30281 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND3P30281 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND3P30281 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND3P30281 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND3P30281 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND3P30281 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND3P30281 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND3P30281 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND3P30281 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND3P30281 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND3P30281 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND3P30281 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND3P30281 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND3P30281 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND3P30281 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND3P30281 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND3P30281 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND3P30281 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND3P30281 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND3P30281 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND3P30281 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND3P30281 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND3P30281 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND3P30281 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCND3P30281 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCND3P30281 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCND3P30281 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCND3P30281 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCND3P30281 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCND3P30281 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCND3P30281 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCND3P30281 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCND3P30281 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCND3P30281 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCND3P30281 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCND3P30281 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCND3P30281 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCND3P30281 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCND3P30281 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCND3P30281 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCND3P30281 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCND3P30281 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCND3P30281 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCND3P30281 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCND3P30281 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCND3P30281 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCND3P30281 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCND3P30281 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCND3P30281 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCND3P30281 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCND3P30281 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCND3P30281 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCND3P30281 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCND3P30281 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms