Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSSP25774 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSSP25774 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSSP25774 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTSSP25774 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSSP25774 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSSP25774 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSSP25774 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSSP25774 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSSP25774 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSSP25774 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSSP25774 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSSP25774 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSSP25774 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSSP25774 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSSP25774 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSSP25774 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSSP25774 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSSP25774 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTSSP25774 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSSP25774 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSSP25774 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSSP25774 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSSP25774 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSSP25774 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSSP25774 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSSP25774 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSSP25774 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSSP25774 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSSP25774 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSSP25774 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSSP25774 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSSP25774 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSSP25774 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTSSP25774 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSSP25774 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSSP25774 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSSP25774 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSSP25774 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSSP25774 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSSP25774 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSSP25774 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSSP25774 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSSP25774 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSSP25774 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSSP25774 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSSP25774 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSSP25774 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSSP25774 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSSP25774 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSSP25774 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSSP25774 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSSP25774 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTSSP25774 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTSSP25774 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTSSP25774 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTSSP25774 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTSSP25774 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTSSP25774 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CTSSP25774 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTSSP25774 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTSSP25774 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTSSP25774 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTSSP25774 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTSSP25774 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTSSP25774 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTSSP25774 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTSSP25774 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTSSP25774 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTSSP25774 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTSSP25774 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CTSSP25774 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CTSSP25774 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTSSP25774 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTSSP25774 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTSSP25774 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CTSSP25774 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTSSP25774 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTSSP25774 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTSSP25774 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTSSP25774 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTSSP25774 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTSSP25774 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTSSP25774 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTSSP25774 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTSSP25774 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTSSP25774 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTSSP25774 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTSSP25774 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTSSP25774 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTSSP25774 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CTSSP25774 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTSSP25774 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTSSP25774 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTSSP25774 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTSSP25774 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTSSP25774 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTSSP25774 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTSSP25774 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTSSP25774 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms