Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP100P23497 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP100P23497 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP100P23497 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP100P23497 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SP100P23497 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP100P23497 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP100P23497 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP100P23497 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP100P23497 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP100P23497 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP100P23497 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP100P23497 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP100P23497 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP100P23497 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SP100P23497 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP100P23497 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP100P23497 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP100P23497 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP100P23497 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP100P23497 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP100P23497 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP100P23497 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP100P23497 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP100P23497 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP100P23497 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP100P23497 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP100P23497 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP100P23497 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP100P23497 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP100P23497 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP100P23497 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP100P23497 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP100P23497 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP100P23497 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP100P23497 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP100P23497 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SP100P23497 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SP100P23497 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SP100P23497 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SP100P23497 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SP100P23497 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SP100P23497 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SP100P23497 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SP100P23497 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SP100P23497 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SP100P23497 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SP100P23497 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SP100P23497 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SP100P23497 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SP100P23497 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SP100P23497 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SP100P23497 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SP100P23497 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SP100P23497 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SP100P23497 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SP100P23497 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SP100P23497 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SP100P23497 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SP100P23497 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SP100P23497 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SP100P23497 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SP100P23497 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SP100P23497 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SP100P23497 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SP100P23497 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SP100P23497 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SP100P23497 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SP100P23497 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SP100P23497 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SP100P23497 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SP100P23497 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SP100P23497 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SP100P23497 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SP100P23497 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SP100P23497 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SP100P23497 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP100P23497 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP100P23497 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP100P23497 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP100P23497 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP100P23497 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP100P23497 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP100P23497 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP100P23497 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP100P23497 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP100P23497 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP100P23497 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP100P23497 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP100P23497 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP100P23497 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SP100P23497 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP100P23497 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP100P23497 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SP100P23497 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP100P23497 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP100P23497 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP100P23497 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP100P23497 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP100P23497 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms