Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
HRCP23327 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
HRCP23327 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
HRCP23327 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
HRCP23327 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
HRCP23327 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
HRCP23327 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
HRCP23327 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
HRCP23327 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
HRCP23327 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
HRCP23327 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
HRCP23327 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
HRCP23327 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
HRCP23327 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
HRCP23327 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
HRCP23327 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
HRCP23327 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
HRCP23327 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
HRCP23327 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
HRCP23327 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
HRCP23327 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
HRCP23327 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
HRCP23327 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
HRCP23327 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
HRCP23327 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
HRCP23327 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
HRCP23327 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
HRCP23327 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
HRCP23327 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
HRCP23327 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
HRCP23327 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
HRCP23327 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
HRCP23327 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
HRCP23327 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
HRCP23327 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
HRCP23327 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
HRCP23327 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
HRCP23327 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
HRCP23327 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
HRCP23327 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
HRCP23327 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
HRCP23327 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
HRCP23327 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
HRCP23327 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
HRCP23327 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
HRCP23327 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
HRCP23327 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
HRCP23327 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
HRCP23327 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
HRCP23327 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
HRCP23327 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
HRCP23327 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
HRCP23327 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
HRCP23327 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
HRCP23327 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
HRCP23327 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
HRCP23327 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
HRCP23327 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
HRCP23327 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
HRCP23327 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
HRCP23327 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
HRCP23327 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
HRCP23327 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
HRCP23327 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
HRCP23327 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
HRCP23327 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
HRCP23327 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
HRCP23327 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
HRCP23327 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
HRCP23327 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
HRCP23327 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
HRCP23327 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
HRCP23327 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
HRCP23327 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
HRCP23327 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
HRCP23327 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
HRCP23327 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
HRCP23327 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
HRCP23327 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
HRCP23327 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
HRCP23327 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC32.32■■■□□ 2.76
HRCP23327 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
HRCP23327 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
HRCP23327 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
HRCP23327 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
HRCP23327 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
HRCP23327 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
HRCP23327 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
HRCP23327 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
HRCP23327 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
HRCP23327 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
HRCP23327 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
HRCP23327 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
HRCP23327 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
HRCP23327 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
HRCP23327 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
HRCP23327 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
HRCP23327 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
HRCP23327 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
HRCP23327 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 209.7 ms