Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT15P19012 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT15P19012 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT15P19012 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT15P19012 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT15P19012 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT15P19012 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT15P19012 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT15P19012 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT15P19012 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT15P19012 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT15P19012 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT15P19012 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT15P19012 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT15P19012 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT15P19012 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT15P19012 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT15P19012 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT15P19012 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT15P19012 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT15P19012 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT15P19012 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT15P19012 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT15P19012 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT15P19012 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT15P19012 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT15P19012 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT15P19012 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT15P19012 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT15P19012 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT15P19012 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT15P19012 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT15P19012 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT15P19012 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT15P19012 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT15P19012 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT15P19012 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT15P19012 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT15P19012 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT15P19012 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRT15P19012 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT15P19012 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT15P19012 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT15P19012 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT15P19012 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT15P19012 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT15P19012 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT15P19012 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT15P19012 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT15P19012 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT15P19012 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT15P19012 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT15P19012 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT15P19012 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT15P19012 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT15P19012 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT15P19012 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRT15P19012 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT15P19012 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT15P19012 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT15P19012 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT15P19012 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT15P19012 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT15P19012 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT15P19012 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT15P19012 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT15P19012 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT15P19012 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT15P19012 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT15P19012 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT15P19012 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT15P19012 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT15P19012 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT15P19012 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT15P19012 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRT15P19012 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT15P19012 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT15P19012 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT15P19012 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT15P19012 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT15P19012 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT15P19012 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT15P19012 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT15P19012 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT15P19012 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT15P19012 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT15P19012 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT15P19012 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT15P19012 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT15P19012 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT15P19012 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRT15P19012 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT15P19012 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT15P19012 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT15P19012 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT15P19012 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT15P19012 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT15P19012 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT15P19012 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRT15P19012 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms