Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.84
RLBP1P12271 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RLBP1P12271 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms