Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ITGAMP11215 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ITGAMP11215 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms