Protein–RNA interactions for Protein: P05060

CHGB, Secretogranin-1, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGBP05060 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHGBP05060 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHGBP05060 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHGBP05060 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CHGBP05060 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHGBP05060 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHGBP05060 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHGBP05060 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHGBP05060 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHGBP05060 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHGBP05060 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHGBP05060 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHGBP05060 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHGBP05060 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHGBP05060 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CHGBP05060 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHGBP05060 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHGBP05060 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHGBP05060 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHGBP05060 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHGBP05060 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHGBP05060 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHGBP05060 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHGBP05060 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CHGBP05060 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHGBP05060 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CHGBP05060 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHGBP05060 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGBP05060 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGBP05060 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGBP05060 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGBP05060 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGBP05060 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGBP05060 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGBP05060 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGBP05060 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGBP05060 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGBP05060 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGBP05060 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGBP05060 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGBP05060 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGBP05060 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGBP05060 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHGBP05060 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHGBP05060 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHGBP05060 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHGBP05060 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHGBP05060 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHGBP05060 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHGBP05060 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CHGBP05060 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHGBP05060 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHGBP05060 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHGBP05060 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHGBP05060 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHGBP05060 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHGBP05060 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHGBP05060 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHGBP05060 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHGBP05060 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CHGBP05060 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHGBP05060 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHGBP05060 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHGBP05060 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHGBP05060 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHGBP05060 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CHGBP05060 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHGBP05060 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHGBP05060 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHGBP05060 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHGBP05060 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHGBP05060 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHGBP05060 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHGBP05060 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHGBP05060 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHGBP05060 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHGBP05060 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHGBP05060 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHGBP05060 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHGBP05060 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHGBP05060 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHGBP05060 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHGBP05060 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHGBP05060 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHGBP05060 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHGBP05060 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHGBP05060 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHGBP05060 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHGBP05060 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHGBP05060 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHGBP05060 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHGBP05060 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHGBP05060 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHGBP05060 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHGBP05060 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHGBP05060 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHGBP05060 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHGBP05060 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHGBP05060 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHGBP05060 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms