Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEC24BO95487 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC24BO95487 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms