Protein–RNA interactions for Protein: O75865

TRAPPC6A, Trafficking protein particle complex subunit 6A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6AO75865 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC6AO75865 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC6AO75865 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC6AO75865 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC6AO75865 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAPPC6AO75865 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC6AO75865 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC6AO75865 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC6AO75865 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC6AO75865 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC6AO75865 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC6AO75865 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC6AO75865 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC6AO75865 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC6AO75865 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC6AO75865 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC6AO75865 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC6AO75865 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC6AO75865 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC6AO75865 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC6AO75865 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC6AO75865 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC6AO75865 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC6AO75865 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAPPC6AO75865 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRAPPC6AO75865 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms