Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SKAP2O75563 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SKAP2O75563 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms