Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NIPSNAP2O75323 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NIPSNAP2O75323 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NIPSNAP2O75323 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NIPSNAP2O75323 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NIPSNAP2O75323 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NIPSNAP2O75323 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NIPSNAP2O75323 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NIPSNAP2O75323 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NIPSNAP2O75323 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NIPSNAP2O75323 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NIPSNAP2O75323 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NIPSNAP2O75323 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NIPSNAP2O75323 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NIPSNAP2O75323 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPSNAP2O75323 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms