Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP3LO60238 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP3LO60238 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP3LO60238 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP3LO60238 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP3LO60238 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP3LO60238 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP3LO60238 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP3LO60238 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BNIP3LO60238 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP3LO60238 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BNIP3LO60238 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP3LO60238 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP3LO60238 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP3LO60238 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP3LO60238 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP3LO60238 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP3LO60238 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP3LO60238 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BNIP3LO60238 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BNIP3LO60238 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BNIP3LO60238 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BNIP3LO60238 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BNIP3LO60238 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BNIP3LO60238 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
BNIP3LO60238 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BNIP3LO60238 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BNIP3LO60238 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BNIP3LO60238 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BNIP3LO60238 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BNIP3LO60238 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BNIP3LO60238 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BNIP3LO60238 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BNIP3LO60238 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BNIP3LO60238 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BNIP3LO60238 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BNIP3LO60238 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BNIP3LO60238 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BNIP3LO60238 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BNIP3LO60238 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BNIP3LO60238 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BNIP3LO60238 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BNIP3LO60238 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BNIP3LO60238 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BNIP3LO60238 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BNIP3LO60238 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BNIP3LO60238 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BNIP3LO60238 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BNIP3LO60238 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BNIP3LO60238 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BNIP3LO60238 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BNIP3LO60238 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BNIP3LO60238 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BNIP3LO60238 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BNIP3LO60238 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BNIP3LO60238 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BNIP3LO60238 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BNIP3LO60238 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BNIP3LO60238 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BNIP3LO60238 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms