Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTIFO43310 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CTIFO43310 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTIFO43310 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTIFO43310 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTIFO43310 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTIFO43310 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTIFO43310 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTIFO43310 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTIFO43310 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTIFO43310 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTIFO43310 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTIFO43310 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
CTIFO43310 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTIFO43310 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTIFO43310 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTIFO43310 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTIFO43310 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTIFO43310 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTIFO43310 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTIFO43310 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTIFO43310 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTIFO43310 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTIFO43310 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CTIFO43310 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTIFO43310 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTIFO43310 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTIFO43310 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTIFO43310 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTIFO43310 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTIFO43310 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTIFO43310 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTIFO43310 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTIFO43310 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTIFO43310 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTIFO43310 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTIFO43310 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTIFO43310 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTIFO43310 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTIFO43310 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTIFO43310 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTIFO43310 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTIFO43310 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTIFO43310 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTIFO43310 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTIFO43310 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTIFO43310 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTIFO43310 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTIFO43310 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTIFO43310 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTIFO43310 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTIFO43310 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTIFO43310 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTIFO43310 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTIFO43310 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTIFO43310 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTIFO43310 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTIFO43310 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTIFO43310 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTIFO43310 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTIFO43310 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTIFO43310 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTIFO43310 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTIFO43310 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTIFO43310 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTIFO43310 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTIFO43310 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTIFO43310 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTIFO43310 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTIFO43310 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTIFO43310 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTIFO43310 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTIFO43310 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTIFO43310 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTIFO43310 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTIFO43310 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTIFO43310 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTIFO43310 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTIFO43310 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTIFO43310 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTIFO43310 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTIFO43310 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTIFO43310 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTIFO43310 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTIFO43310 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTIFO43310 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTIFO43310 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTIFO43310 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTIFO43310 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTIFO43310 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTIFO43310 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTIFO43310 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTIFO43310 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CTIFO43310 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTIFO43310 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTIFO43310 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTIFO43310 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTIFO43310 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTIFO43310 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTIFO43310 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
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