Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MSH5O43196 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MSH5O43196 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MSH5O43196 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MSH5O43196 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MSH5O43196 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MSH5O43196 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MSH5O43196 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MSH5O43196 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MSH5O43196 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MSH5O43196 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MSH5O43196 AC027281.2-201ENST00000623856 713 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MSH5O43196 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MSH5O43196 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MSH5O43196 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MSH5O43196 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MSH5O43196 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MSH5O43196 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MSH5O43196 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MSH5O43196 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MSH5O43196 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MSH5O43196 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MSH5O43196 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MSH5O43196 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MSH5O43196 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MSH5O43196 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MSH5O43196 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MSH5O43196 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MSH5O43196 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MSH5O43196 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MSH5O43196 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MSH5O43196 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MSH5O43196 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MSH5O43196 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MSH5O43196 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MSH5O43196 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MSH5O43196 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MSH5O43196 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MSH5O43196 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MSH5O43196 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MSH5O43196 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MSH5O43196 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MSH5O43196 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MSH5O43196 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MSH5O43196 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MSH5O43196 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MSH5O43196 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MSH5O43196 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
MSH5O43196 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
MSH5O43196 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MSH5O43196 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MSH5O43196 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MSH5O43196 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MSH5O43196 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MSH5O43196 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MSH5O43196 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MSH5O43196 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MSH5O43196 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MSH5O43196 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MSH5O43196 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
MSH5O43196 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MSH5O43196 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MSH5O43196 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MSH5O43196 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MSH5O43196 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MSH5O43196 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MSH5O43196 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MSH5O43196 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MSH5O43196 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MSH5O43196 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MSH5O43196 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MSH5O43196 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MSH5O43196 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MSH5O43196 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MSH5O43196 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MSH5O43196 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MSH5O43196 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MSH5O43196 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MSH5O43196 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MSH5O43196 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MSH5O43196 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MSH5O43196 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MSH5O43196 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MSH5O43196 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MSH5O43196 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MSH5O43196 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MSH5O43196 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MSH5O43196 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSH5O43196 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSH5O43196 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSH5O43196 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSH5O43196 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSH5O43196 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSH5O43196 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSH5O43196 AL139353.2-202ENST00000502430 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSH5O43196 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSH5O43196 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSH5O43196 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSH5O43196 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSH5O43196 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms