Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SYNJ2O15056 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SYNJ2O15056 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SYNJ2O15056 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SYNJ2O15056 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SYNJ2O15056 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SYNJ2O15056 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
SYNJ2O15056 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SYNJ2O15056 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SYNJ2O15056 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SYNJ2O15056 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SYNJ2O15056 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SYNJ2O15056 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SYNJ2O15056 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SYNJ2O15056 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SYNJ2O15056 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SYNJ2O15056 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SYNJ2O15056 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYNJ2O15056 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYNJ2O15056 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYNJ2O15056 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYNJ2O15056 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYNJ2O15056 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYNJ2O15056 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYNJ2O15056 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYNJ2O15056 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYNJ2O15056 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYNJ2O15056 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYNJ2O15056 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
SYNJ2O15056 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SYNJ2O15056 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms