Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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