Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HACD1B0YJ81 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HACD1B0YJ81 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms