Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAMTA1Q9Y6Y1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMTA1Q9Y6Y1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms