Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRPC4Q9UBN4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRPC4Q9UBN4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms