Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL9Q9P2J3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms