Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX43Q9NXZ2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms