Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COMMD8Q9NX08 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COMMD8Q9NX08 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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