Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS98

SEMA3G, Semaphorin-3G, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3GQ9NS98 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA3GQ9NS98 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEMA3GQ9NS98 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms