Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG3

UBN1, Ubinuclein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBN1Q9NPG3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBN1Q9NPG3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms