Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB3

CABP2, Calcium-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP2Q9NPB3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CABP2Q9NPB3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms