Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms