Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1DQ9H5J8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TAF1DQ9H5J8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms