Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MED28Q9H204 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MED28Q9H204 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms