Protein–RNA interactions for Protein: Q9H040

SPRTN, SprT-like domain-containing protein Spartan, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTNQ9H040 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SPRTNQ9H040 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms