Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CEP44Q9C0F1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms