Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CELF4Q9BZC1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms