Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLDIP3Q9BY77 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLDIP3Q9BY77 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLDIP3Q9BY77 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLDIP3Q9BY77 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLDIP3Q9BY77 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLDIP3Q9BY77 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLDIP3Q9BY77 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLDIP3Q9BY77 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLDIP3Q9BY77 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLDIP3Q9BY77 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLDIP3Q9BY77 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLDIP3Q9BY77 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLDIP3Q9BY77 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLDIP3Q9BY77 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLDIP3Q9BY77 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLDIP3Q9BY77 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLDIP3Q9BY77 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms