Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RIOK2Q9BVS4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RIOK2Q9BVS4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RIOK2Q9BVS4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RIOK2Q9BVS4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RIOK2Q9BVS4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RIOK2Q9BVS4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIOK2Q9BVS4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIOK2Q9BVS4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIOK2Q9BVS4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIOK2Q9BVS4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIOK2Q9BVS4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIOK2Q9BVS4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIOK2Q9BVS4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIOK2Q9BVS4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIOK2Q9BVS4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIOK2Q9BVS4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RIOK2Q9BVS4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIOK2Q9BVS4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIOK2Q9BVS4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIOK2Q9BVS4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIOK2Q9BVS4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIOK2Q9BVS4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RIOK2Q9BVS4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIOK2Q9BVS4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIOK2Q9BVS4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIOK2Q9BVS4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RIOK2Q9BVS4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RIOK2Q9BVS4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RIOK2Q9BVS4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RIOK2Q9BVS4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms