Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT09

CNPY3, Protein canopy homolog 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY3Q9BT09 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CNPY3Q9BT09 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNPY3Q9BT09 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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