Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RIOK1Q9BRS2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RIOK1Q9BRS2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms