Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUP88Q99567 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUP88Q99567 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms