Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms