Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2E2Q96LR5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms