Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHFRQ96EP1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHFRQ96EP1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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