Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RAD50Q92878 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD50Q92878 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms