Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HERVK_113Q902F9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HERVK_113Q902F9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms