Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ATRIPQ8WXE1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms