Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU0

DDI1, Protein DDI1 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDI1Q8WTU0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
DDI1Q8WTU0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDI1Q8WTU0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms