Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BEST2Q8NFU1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEST2Q8NFU1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms