Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC43Q8N309 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC43Q8N309 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC43Q8N309 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC43Q8N309 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC43Q8N309 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC43Q8N309 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC43Q8N309 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC43Q8N309 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC43Q8N309 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC43Q8N309 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC43Q8N309 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC43Q8N309 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC43Q8N309 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC43Q8N309 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC43Q8N309 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC43Q8N309 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC43Q8N309 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC43Q8N309 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC43Q8N309 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC43Q8N309 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC43Q8N309 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC43Q8N309 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms