Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERC6Q8IVU3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERC6Q8IVU3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms