Protein–RNA interactions for Protein: Q86VH5

LRRTM3, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3Q86VH5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRTM3Q86VH5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRTM3Q86VH5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms